Ocupă arhipelagul cu același nume din E Asiei. Numără peste 6.000 de insule, din care 4 sunt mari: Hokkaido, Honshu, Shikoku, KyuShu.

Fiind situată la contactul plăcilor tectonice a Filipinelor, Pacifică și Euroasiatică, Japonia este străbătută de numeroase lanțuri muntoase și zguduită de peste 1500 de cutremure anual. Din cei peste 200 de vulcani, 20 sunt activi. Cel mai mare și mai cunoscut este Fuji (3.776 m).